Nel 1999 si sono tenuti vari incontri della commissione: il 14 gennaio a Roma, il 2 maggio a Parma e il 28 ottobre di nuovo a Roma; si cerca di trovare la via giusta per sensibilizzare le comunità al dialogo; si è tentato di responsabilizzare i partecipanti alla commissione, suddividendo l'Italia in tre parti (Nord, Centro, Sud e isole) e affidando alle singole persone l'impegno per alcune regioni.
Intanto si è continuata la serie dei convegni "A scuola del monachesimo", organizzando ancora a Parma un incontro su "Come vivere insieme" di cui sono stati pubblicati gli Atti.
È stato possibile anche svolgere un pellegrinaggio di dialogo in Egitto (29 agosto - 4 settembre) con l'incontro molto gioioso con i monaci copti ortodossi.
All'incontro europeo a Douay Abbey (Inghilterra) ha partecipato p. Cipriano Carini.
L'anno è terminato con una buona partecipazione di monaci e monache all'Assemblea interreligiosa tenuta in Vaticano (24-29 ottobre) che voleva ripetere Assisi 1986.